In de 31e eeuw valt de aarde onder de heerschappij van de kwaadaardige keizer Biljartbal IV, die mensen met haar haat, waarschijnlijk uit jaloezie. Daarom besluit hij een leger Hair Hunters op te richten, die zich inzetten voor het scheren van mensen over de hele wereld. Bobobo, die sinds zijn jeugd het bijzondere vermogen had om met zijn eigen haar te communiceren, wordt gedwongen om te vechten tegen Bola de Billar IV en neemt het pseudoniem 'El liberta-cabelleras' aan. Met de hulp van steeds meer personages die net zo divers zijn als hij, zal hij de verschillende divisies van het leger van de kwaadaardige keizer verslaan, totdat hij een wereld creëert waarin het haar van mensen vrij kan zijn...