Sakura avait réussi à s'emparer de toutes les cartes Clow susceptibles de semer le chaos dans le monde et les avait transformées en ses propres cartes Sakura. C'est désormais le printemps. Alors que les cerisiers sont en pleine floraison, Sakura entre au collège. Son bien-aimé Shaoran est de retour de Hong Kong, et Sakura est ravie de pouvoir à nouveau aller à l'école avec lui. Mais une nuit, quelque chose d'étrange arrive à ses cartes...