Em 1864, no Japão, uma jovem chamada Chizuru Yukimura está à procura do seu pai desaparecido, Koudou, um médico. Mas, sem notícias dele há meses, Chizuru disfarça-se de homem e dirige-se a Quioto em busca dele. Atraindo a atenção de ronins, ela tenta esconder-se e acaba por testemunhar uma cena horrífica: os ronins sendo brutalmente assassinados por homens loucos de cabelo branco. Em um giro surpreendente dos acontecimentos, membros do Shinsengumi chegam para eliminar as criaturas. Mas a segurança de Chizuru não dura muito, pois este grupo de homens amarra-a e leva-a de volta para o seu quartel, incertos sobre deixá-la viver ou silenciá-la permanentemente. No entanto, assim que ela revela o nome do seu pai, o Shinsengumi decide mantê-la a salvo, pois também têm estado à procura dele. Mas Koudou está mais ligado ao Shinsengumi do que eles deixam transparecer, e em breve Chizuru se vê envolvida em um conflito entre o Shinsengumi e os seus inimigos, além da tensão política em Quioto.