1 maja 1945 roku w Berlinie, Armia Czerwona wznosi sowiecką flagę nad Reichskanzlei. W tym czasie, grupa funkcjonariuszy nazistowskich, przeprowadza rytuał. Sytuację w mieście traktują jako doskonałą ofiarę, aby przywrócić Zakon 13 Kopij, grupy nadludzi, których przyjście na świat przyniesie zniszczenie. Wiele lat później, nikt nie wie, czy się udało, czy przeżyli. Niewielu ich pamięta, a z roku na rok jest ich coraz mniej. Obecnie, w Suwahara City, Ren Fujii spędza dni w szpitalu. Minęły dwa miesiące, od kiedy tu trafił. Stało się tak, ponieważ pobił się ze swoim przyjacielem: Shirou Yusa. Próbuje docenić to co mu zostało, ale przeszkadza mu w tym koszmar, który wraca do niego co noc: gilotyna, morderca, ubrany na czarno rycerz. Jest zdesperowany, aby wrócić do swojego normalnego życia, ale nawet teraz słyszy słowa Shiro: "Każdy, kto pozostaje w tym mieście w końcu traci rozum".