Świat uległ diametralnej zmianie, kiedy nagle pojawiły się potwory zwane Smokami. Od dawien dawna wśród ludzi rodziły się specjalne dziewczynki z nadnaturalnymi mocami smoków – dzieci te zwano „D”. Jest jednak pewien wielce strzeżony sekret – istnieje też jeden jedyny chłopak będący „D”, na imię ma Yuu Mononobe i zostaje on wbrew własnej woli przeniesiony do szkoły Midgar, placówki gdzie zebrano wszystkie dziewczęta D. Nowe miejsce od samego początku dostarcza mu sporo wrażeń, szczególnie kiedy wpada na nagą Iris, będącą jedną z tamtejszych uczennic, czy też spotyka swoją, jak do tej pory uważał, zaginioną siostrę – Mitsuki. „Tylko jeśli nie będę miał żadnego innego wyboru Iris, tylko wtedy Cię zabiję”. „Czy naprawdę… mogę ci zaufać?” Kurtyna podnosi się nad „jedyną i niepowtarzalną opowieścią” o chłopaku, który miał zostać najpotężniejszym zabójcą oraz o nieudolnej dziewczynie - Iris.