Hitomi is een meisje zoals talloze anderen - sportliefhebber, stiekem verliefd op een klasgenoot en gefascineerd door het blootleggen van de geheimen van haar toekomst door middel van kaartlezen. Maar sinds enige tijd wordt Hitomi geplaagd door vreemde nachtmerries van gepantserde kolossen, dappere ridders en machtige monsters. Op een dag wordt een van deze visioenen plotseling werkelijkheid en komen Hitomi en haar vrienden oog in oog te staan met een gigantische draak. Gescheiden van haar vrienden bevindt Hitomi zich in een andere wereld, bevolkt door buitenaardse wezens en midden in een wrede veroveringsoorlog. Aan de zijde van de jonge prins Van, de dappere ridder Allen en de levendige Merle probeert ze het geheim op te lossen dat haar hier heeft gebracht... het mysterie van Escaflowne!