Aono Tsukune heeft het niet gemakkelijk. In het begin weerhouden zijn slechte cijfers hem ervan zich in te schrijven op een van zijn favoriete scholen en wanneer hij min of meer toevallig een school vindt, blijkt het een school voor youkai te zijn. Aangezien hij de enige mens onder de youkai is - en dus daarmee natuurlijk op het ene of het andere menu staat - moet hij constant vrezen voor zijn leven en zou zijn schoolleven waarschijnlijk één grote marteling zijn als er geen sprankje hoop was, namelijk de vampier Moka, op wie Tsukune vrij snel verliefd wordt. Samen met haar en enkele andere meisjes die later toetreden, worstelt Tsukune zich door het dagelijkse schoolleven, dat een beetje anders is dan wat we gewend zijn op menselijke scholen.