Ergens in de toekomst: buitenaardse wezens leven onder ons. Het zijn prachtige wezens en worden DearS genoemd. Om ervoor te zorgen dat ze de gewoonten van de mensen beter leren, worden ze naar willekeurig geselecteerde scholen gestuurd. Wanneer de jonge Takeya een DearS ontmoet op zijn school en haar voorlopig in huis neemt, begint het verhaal pas echt: Ren, de DearS, is volkomen hulpeloos en kent geen Japans of de gewoonten van mensen. Takeya moet haar dus instrueren in de basisprincipes van het mens-zijn, maar maakt ook misbruik van haar hulpeloosheid. Hij leert van Ren dat de aliens een noodlanding op aarde moesten maken en daarom proberen te integreren in de samenleving. Er ontstaat een vreemde maar grappige relatie tussen Ren en Takeya.