Den mytiske by Camelot er et fantastisk rige af legendariske væsener og mystiske folk. I denne farlige verden er magi blevet bandlyst af den skånselsløse tyran Uther Pendragon. Merlin, en ung mand med ekstraordinære, magiske kræfter, ankommer til Camelots porte, sendt ud af sin mor for at påbegynde et nyt liv. Overvældet af byens mange vidundere får den unge troldmand hurtigt skabt sig fjender, inklusive arvingen til Uthers krone, den egenrådige Prins Arthur. Vejledt af Uthers vise læge, Gaius, begynder Merlin snart at bruge sine talenter - ikke bare til at overleve, men også til at åbne for Camelots mystiske hemmeligheder. Men i sin færd opdager han, at hans skæbne er uløseligt forbundet med kongerigets unge tronfølger, Arthur.