В град Митакихара живее ученичка на име Мадока Канаме, която заедно с приятелката си Саяка Мики получава предложение от странната Кайюбей. Тя предлага на момичетата да им изпълни по едно желание, но още преди да са обмислили това изкушаващо предложение двете приятелки са посетени от тяхната връстничка Хомура Акеми, която ги предупреждава да не се доверяват на Кайюбей. Кайюбей обещава на Мадока, че ще я превърне в най-могъщата магьосница на света, но Хомура, която е една от предишните жертви на този процес, прави всичко възможно за да попречи на младото момиче да приеме офертата. Мадока се двоуми, тъй като хората които се сдобиват със свръхестествени сили са принудени да се борят срещу жестоки вещици и същества, които сеят смърт и карат много хора да се самоубиват. Ще приеме ли младото момиче предложението на Кайюбей или ще се довери на казаното от Хомура?